Nhiệm kỳ hai ở Chelsea, thời gian làm việc hai năm và 197 ngày (2013-2015): Giống những gì từng diễn ra trong nhiệm kỳ đầu, uy tín của Mourinho sa sút ở mùa thứ ba. Trong 12 vòng đầu, Chelsea để mất tới 11 điểm và sớm rơi ra ngoài cuộc đua Ngoại hạng Anh. Bên ngoài sân, mối quan hệ giữa Mourinho và cầu thủ cũng rơi vào khủng hoảng. Ông không ngần ngại cáo buộc Fabregas, Hazard và Diego Costa là những ''con chuột phá hoại Chelsea''. Không còn lựa chọn nào khác, sau khi Chelsea thua chín trong 16 trận đầu, ông chủ Abramovich một lần nữa sa thải "Người Đặc Biệt''.